AI有望讓腫瘤細(xì)胞無處遁形
本報記者李惠鈺
如果腫瘤細(xì)胞剛剛生成，就可以被精準(zhǔn)地揪出來，那將給腫瘤的診斷和治療帶來巨大變革。而要想實現(xiàn)這一點，成像方式就必須具有極高的靈敏度。
近日，中科院自動化研究所、中科院分子影像重點實驗室在基于人工智能（AI）技術(shù)的新型成像方法研究上獲得了突破性進展研究人員將小鼠顱內(nèi)腦膠質(zhì)瘤的三維定位精度，由傳統(tǒng)方法的百微米級誤差縮小到了十微米級，為疾病動物模型乃至臨床患者的影像學(xué)研究提供了全新的思路。相關(guān)研究論文已發(fā)表于《光》期刊。
圖像不是憑空得到的，而是成像設(shè)備獲得的，傳統(tǒng)方法往往不能提供最好的成像質(zhì)量。在人類認(rèn)知圖像之前，在成像信號轉(zhuǎn)化為圖像的過程中，會損失很多關(guān)鍵信息，人工智能技術(shù)可以突破這一瓶頸。論文第一作者、中科院自動化研究所副研究員王坤告訴《中國科學(xué)報》，通過建立新的AI模型，機器人維修，把原始的物理信號轉(zhuǎn)化為更加精確、更高分辨、更少偽影、更高信噪比的高質(zhì)量圖像，無論是人腦還是機器腦，都可以更好地識別、認(rèn)知和學(xué)習(xí)，這就是此項研究帶來的最本質(zhì)的創(chuàng)新。
一項極具挑戰(zhàn)性的工作
腫瘤的早期發(fā)現(xiàn)并不容易，特別是某些惡性腫瘤，潛伏期甚至長達20年，當(dāng)身體發(fā)出警報時，往往已經(jīng)走到了中晚期。如何實現(xiàn)早期微小腫瘤的精準(zhǔn)檢測，及時觀測到腫瘤細(xì)胞剛出現(xiàn)時產(chǎn)生的某些特異性蛋白、酶甚至RNA，一直是科學(xué)家探索和研究的方向。
不過，在現(xiàn)實的物理世界中，能夠提供如此高靈敏度的成像媒介并不多。王坤坦言，目前公認(rèn)最好的是高能伽馬射線和無輻射的光子，但是基于伽馬探測的放射性核素成像成本高，難以普及；光學(xué)成像成本低廉，但大都是二維圖像，缺乏三維信息。
我們用人工智能解決的就是光學(xué)成像難以三維定量的問題。王坤說，也就是既可以高靈敏度地看到有沒有腫瘤，是哪種分子類型的腫瘤，還可以高精確度地知道腫瘤在哪里，有多大規(guī)模。
王坤提到的光學(xué)成像是指生物自發(fā)光斷層成像技術(shù)，該技術(shù)是生物醫(yī)學(xué)成像的重要手段，廣泛應(yīng)用于疾病動物模型的影像學(xué)研究。然而，由于光子在生物體內(nèi)具有非均勻化的高散射和高吸收的物理特性，通過探測動物體表的發(fā)光光斑來逆向重建出生物體內(nèi)的光源位置（即腫瘤位置），是一項極具挑戰(zhàn)性的工作。
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系研究員羅建文告訴《中國科學(xué)報》，此前，光學(xué)斷層重建問題大多是基于模型的方法，包括正問題和逆問題的求解。正問題的求解一般是利用輻射傳輸方程或者擴散方程等模型來模擬光子在組織體中的傳播過程，進而得到系統(tǒng)矩陣；逆問題的求解大多采用一些優(yōu)化方法，來獲得體內(nèi)光源的具體信息，如位置、形態(tài)、強度等。
然而，這種基于模型的方法，勢必會受到模型近似的影響，導(dǎo)致重建精度降低。羅建文強調(diào)。據(jù)了解，正問題和逆問題求解的兩種誤差疊加在一起，最終導(dǎo)致光學(xué)斷層成像對于動物體內(nèi)腫瘤的三維定位具有數(shù)百微米到1毫米的誤差。
機器學(xué)習(xí)帶來突破
為減少誤差，王坤所在團隊提出基于機器學(xué)習(xí)的AI重建：完全舍棄構(gòu)建前向模型去描述光子在生物體內(nèi)的傳播，通過構(gòu)建大量的仿真數(shù)據(jù)集，在仿真數(shù)據(jù)上確定動物體表的光斑和體內(nèi)的光源，再通過該數(shù)據(jù)集訓(xùn)練計算機智能化學(xué)習(xí)體表光斑和體內(nèi)光源的非線性關(guān)系，從而構(gòu)建出適用于生物自發(fā)光斷層成像的AI模型，最終三維重建活體動物荷瘤模型內(nèi)的腫瘤三維分布。
此項研究首次將機器學(xué)習(xí)中的多層感知機方法應(yīng)用于光學(xué)斷層重建，并且提出了自己的數(shù)據(jù)集構(gòu)造方法，實現(xiàn)了直接由數(shù)據(jù)到結(jié)果的跨模型創(chuàng)新框架，使得重建定位誤差縮小到傳統(tǒng)方法的十分之一，同時這也提示了可以用人工智能方法去解決光學(xué)斷層重建問題。羅建文評價道。
不過，王坤強調(diào)，生物自發(fā)光斷層成像涉及到腫瘤細(xì)胞的基因編輯和改造，所以只能用在動物身上，不能用于人體，但是他們發(fā)展出的基于AI的光學(xué)三維重建方法具有推廣性，理論上可以用在其它光學(xué)分子影像的成像技術(shù)上，例如激發(fā)熒光成像、近紅外成像等等。因此，該方法本身具有很好的臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用能力。
數(shù)據(jù)收集與分析面臨挑戰(zhàn)
機器學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)是數(shù)據(jù)，而對于生物醫(yī)學(xué)成像來說，構(gòu)建大數(shù)據(jù)集是非常困難的事情。
比如我們的這個研究，構(gòu)建了近8000個腦膠質(zhì)瘤荷瘤的小鼠模型來訓(xùn)練我們的機器學(xué)習(xí)模型。如果真的讓生物學(xué)家去一個個構(gòu)建原位腦膠質(zhì)瘤小鼠模型，需要很長時間，并投入巨大的人力和財力，是非常不切實際的。王坤說。
我們構(gòu)建的仿真數(shù)據(jù)，達到了非常高的精度，很好地模擬了現(xiàn)實的腫瘤動物。王坤表示，他們用生物學(xué)家構(gòu)建的真實腦膠質(zhì)瘤小鼠來驗證訓(xùn)練出來的人工智能模型是否精確可靠，最終結(jié)果表明，新型人工智能方法對于腦膠質(zhì)瘤的三維定位誤差均小于80微米，而傳統(tǒng)方法的定位誤差為350微米以上。
不過，在實際臨床應(yīng)用中，數(shù)據(jù)的收集和解析并不容易。羅建文表示，機器學(xué)習(xí)特別是深度學(xué)習(xí)，最重要的就是數(shù)據(jù)，包括數(shù)據(jù)的質(zhì)量和數(shù)量。目前在醫(yī)學(xué)成像領(lǐng)域，雖然收集到大量的數(shù)據(jù)比較容易，但是這些數(shù)據(jù)被標(biāo)記后才能用于建模，受個體差異影響很大。由于不同醫(yī)生的診斷結(jié)果不同，數(shù)據(jù)的質(zhì)量會受到影響，庫卡機器人驅(qū)動器維修，用它訓(xùn)練出的網(wǎng)絡(luò)就會存在問題。
同時，羅建文表示，機器人維修，在診斷、治療、預(yù)后等一系列環(huán)節(jié)中，對于一些疾病的定性描述，不同的醫(yī)生也存在很大的自由度，很難統(tǒng)一說法；不同品牌甚至同一品牌但不同型號的醫(yī)療設(shè)備采集到的圖像，也存在較大差異。這些不統(tǒng)一的數(shù)據(jù)，都會影響深度學(xué)習(xí)的分析結(jié)果。
還有一個重要的因素就是模型的因果性和可解釋性。羅建文強調(diào)，醫(yī)學(xué)與人的生命息息相關(guān)，所以做任何一件事都要有理有據(jù)，都要有因果推論的關(guān)系。但是，做機器學(xué)習(xí)模型時，很容易陷入直接對相關(guān)性進行建模的陷阱。相關(guān)性建模涉及的兩個因素未必有直接的因果關(guān)系。得出的模型，如何解釋其結(jié)果的意義，是一個很難處理的事情。
臨床任重道遠(yuǎn)
在羅建文看來，深度學(xué)習(xí)擅長處理的就是高維度、稀疏的信號，圖像就是這些信號中一種有代表性的形式，因此，AI在醫(yī)學(xué)影像處理上的應(yīng)用必然是一個熱點方向。
醫(yī)學(xué)影像處理的典型問題包括影像分類、目標(biāo)檢測、圖像分割和影像檢索等，都能對應(yīng)到日常臨床應(yīng)用里的一些痛點或比較浪費人力的問題。羅建文建議，影像醫(yī)師應(yīng)該投入到AI技術(shù)的學(xué)習(xí)和應(yīng)用中，AI技術(shù)也許很快就能協(xié)助影像醫(yī)生完成一部分工作，也有潛力使現(xiàn)有的工作得到提升。
不過，上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院放射科主任詹松華站在醫(yī)生的角度表示，AI在發(fā)現(xiàn)病變方面肯定大有作為，但是代替醫(yī)生來處理，很難。發(fā)現(xiàn)病變特點，然后區(qū)別正常和異常，到底是炎癥還是腫瘤，最終還是由醫(yī)生來做診斷。